本文转自中国生物技术发展中心，转发仅为学习交流，若侵犯版权请联系小编删除。

患者来源的类器官培养已经成为研究肿瘤分子机制的常用手段，但暂无研究从单细胞水平对构建的类器官个体内部肿瘤细胞异质性进行评估。近日，北京大学生物医学前沿创新中心与北京大学第三医院合作在《Genome Biology》杂志发表了题为“Systematic evaluation of colorectal cancer organoid system by single-cell RNA-Seq analysis”的文章。

研究团队对来自7名结直肠癌患者的体内肿瘤组织、癌旁正常组织，以及对它们进行体外培养构建的相应类器官进行了高精度单细胞转录组测序，并结合全基因组甲基化测序、全基因组测序、全外显子组测序等技术，对两种常见结直肠类器官培养体系从转录组、基因组和DNA甲基化组3个层面进行了系统的比较和评估。研究发现，一是肿瘤组织来源的类器官能准确反映对应体内肿瘤上皮细胞在基因表达、基因突变以及DNA甲基化等方面的关键特征，是肿瘤发生分子机制研究的良好平台。二是癌旁正常组织来源的类器官在转录组水平上同样表现出部分肿瘤样特征，因此无法用同一个患者得到的肿瘤类器官和正常肠上皮类器官进行候选药物筛选。三是现有的两种培养体系对于维持结直肠癌肿瘤细胞关键生物学特征都有效，但是条件培养基要优于分子培养基，因而条件培养基是结直肠癌肿瘤发生分子机制研究和药物筛选的首选培养体系。

该研究系统评估了体外结直肠癌类器官培养体系的可靠性和局限性，为结直肠癌肿瘤发生分子机制研究和药物筛选提供重要依据。

论文链接：https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-022-02673-3

注：此研究成果摘自《Genome Biology》杂志，文章内容不代表本网站观点和立场，仅供参考。