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空间转录组技术是研究复杂生物过程（如哺乳动物的胚胎发育）的工具。然而，目前的方法受分辨率、基因捕获区域和观察视野等限制，无法用于分析体积较大、三维的妊娠中期和晚期胚胎研究。利用DNA纳米球阵列芯片和原位mRNA捕获技术，深圳华大基因研究院等研究团队绘制了小鼠器官发生的时空转录组图谱。该论文近日发表在《Cell》杂志上，题为：Spatiotemporal transcriptomic atlas of mouse organogenesis using DNA nanoball-patterned arrays。

研究人员综合运用DNA纳米球阵列芯片和原位mRNA捕获技术，创建了空间增强分辨率的全基因组测序技术（Stereo-seq）。该测序技术具有单细胞分辨率和高灵敏度，他们应用该技术绘制了小鼠器官发育的时空转录组图谱（MOSTA），描绘了发育过程中转录组的变化和动力学特征。利用这些信息，研究人员深入了解了发育组织的空间分布以及细胞命运调控过程的分子基础，如发现背侧中脑组织在不同胚胎时间点，祖细胞与其分化细胞存在空间分布异质性。

总之，该研究绘制的全景图谱将有助于深入研究哺乳动物正常或异常发育涉及的相关问题。

论文链接：https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(22)00399-3

注：此研究成果摘自《Cell》杂志，文章内容不代表本网站观点和立场，仅供参考。